空調若不定期清洗消毒，富集在空調里的灰塵、微生物及放射性粒子隨風吹散到室內，就可能被人體吸收，積累到一定量的時候便會引發人體出現亞健康狀態和多種疾病。比如，感覺頭暈、乏力、容易感冒、發燒；呼吸道疾��；過敏性肺炎、皮膚過敏等，這就是空調污染。
人的活動和不潔凈的室內空氣是造成空調污染的罪魁禍首。室內空氣被吸入空調系統內部，空氣中的粉塵等顆粒物、細菌、病毒等微生物就會附著在潮濕的換熱器表面，并在合適的溫濕度條件下大量滋生，因此也有人將空調稱為二次污染源。
同時，空調內部的污染物還會存在于風機、空氣連接管等整個系統內，這些都會通過散熱片散發到室內。